生信友好肿瘤期刊新上映_生信友好肿瘤期刊怎么样(2024年11月抢先看)
闭眼投的纯生信医学SCI,真的香! 嘿,生信朋友们!你们是不是也在为投哪篇SCI而发愁?别担心,我来给你们推荐几篇对生信友好的SCI期刊,真的香!闭眼投,录用率杠杠的! 《Journal of Translational Medicine》 这本期刊可是2区的,影响因子有6.1,自引率才1.6%。主要收纯生信文章,对生信工作量和可视化程度要求不高,录用率有50%呢!简直是生信小伙伴们的福音。 《Cancer Letters》 这可是1区的期刊,影响因子高达9.1,自引率6.6%。主要收医学和肿瘤学的文章。审稿周期大概2.7个月,录用率也有52%。闭眼投,录用率杠杠的! 《Cancer Gene Therapy》 这本期刊是3区的,影响因子4.8,自引率2.1%。主要收医学、遗传学、生物工程和应用微生物、肿瘤学等方面的文章。虽然接受时间有点慢,但录用率很高,值得一试。 《Breast Cancer Research》 这可是1区的期刊,影响因子6.1,自引率1.6%。主要收乳腺癌研究的文章,审稿周期3个月,录用率也很高。对乳腺癌研究方向的朋友们来说,这绝对是个好选择。 《OncoTargets and Therapy》 这本期刊是4区的,影响因子2.7,自引率6.6%。主要收医学、肿瘤学、生物工程和应用微生物的文章。专注于所有类型癌症的分子诊断和靶向分子或精确治疗,录用率高且慢。 《Genomics》 这是2区的期刊,影响因子3.4,自引率2.1%。主要收生物学、生物工程和应用微生物、遗传学的文章。录用率40%,审稿周期1.5个月,对国人友好度高,高分生信文章的好去处。 总之,这些期刊对生信文章都很友好,闭眼投,录用率杠杠的!希望对你们有帮助,赶紧试试吧!
生信分析新视角:信号通路的研究潜力 在生物信息学的探索中,信号通路这一领域尚未被充分发掘,它为科研人员提供了一个充满机遇的研究方向。信号通路不仅在肿瘤学中具有重要意义,还与多种非肿瘤性疾病紧密相关,这使得它成为生物信息学研究的一个广阔领域。 信号通路的广泛性:一个信号通路可能涉及多种疾病,无论是肿瘤还是非肿瘤性疾病,都能从中找到关联。 基因集的完整性:信号通路本身包含众多基因,这为研究者提供了一个完整的基因集,无需从多个途径寻找基因。 젦𖥮验的便利性:信号通路作为调控机制,研究完成后,可以更方便地延伸到机制实验,为后续研究打下基础。 竞争压力小:目前,专注于信号通路的生物信息学研究相对较少,这为研究者提供了广阔的发文空间。 这些优势使得信号通路成为生物信息学研究的一个值得考虑的方向。对于那些对生物信息学充满热情的科研人员来说,信号通路无疑是一个充满挑战和机遇的领域。
生信SCI分析、网络药理与分子对接全攻略 生信SCI分析辅导 下载肿瘤TCGA数据库的表达谱数据和临床数据,进行差异分析和富集分析。 利用热图、聚类、PCA、相关性、Venn图、弦图、桑基图、森林图、boxplot图、复杂热图、火山图等进行数据可视化。 进行SCI全套分析,包括肿瘤分析、单基因分析、铜死亡、铁死亡、焦亡、衰老、自噬等热门套路分析,构建预后模型和临床模型。 젥子对接 获取核心靶点和关键成分文件。 进行分子对接前处理。 运行分子对接结果。 可视化处理分子对接结果。 分子动力学模拟 展示四个图(对接图+三个场环境图)。 网络药理学 获取药物成分与靶点。 收集疾病靶点。 绘制韦恩图,筛选交集靶点。 构建PPI网络图,筛选核心靶点。 绘制药物-成分-靶点-疾病网络关系图,筛选关键成分。 进行GO和KEGG富基分析。
微生物药物合成中生物信息学研究相关图片 深入探索生信分析的最新进展,尤其是单细胞测序和空间转录组测序的方法。如果你对这些领域感兴趣,不妨查阅图5和6,它们详细介绍了方法步骤。此外,还有更多关于单细胞测序、空间转录组测序以及公共数据挖掘的知识等你来发现! 金凤实验室的研究团队在最新研究中取得了一项重大发现:他们发现了恶性胶质瘤内一种全新的肿瘤相关巨噬细胞(TAM),并揭示了其在肿瘤血管正常化中的潜在疗效。这项突破性研究由陆军军医大学第一附属医院(重庆西南医院)的卞修武院士、时雨副教授以及平轶芳教授领导的团队与祁淑红副研究员合作完成,并于最近在《Cancer Cell》杂志上发表。 通过单细胞多组学技术,研究团队绘制了恶性胶质瘤内肿瘤相关巨噬细胞的空间图谱,并发现了一种富集于缺氧坏死区的新型亚群,被称为缺氧亚群(Hypoxia-TAM)。这些巨噬细胞能够诱导微血管渗漏,导致肿瘤微血管结构异常,从而限制了抗肿瘤药物的递送效果。⚠⚠⚠ 进一步研究发现,缺氧环境中的肿瘤因子和缺氧因素是诱导这种新型亚群形成的关键因素。团队证实,胶质瘤细胞分泌的富含半胱氨酸的蛋白质和低氧条件下产生的乳酸能够促进这些巨噬细胞向缺氧亚群表型转化,并引发血管高渗漏的现象。 这一发现为开发新型的肿瘤治疗策略提供了重要线索。通过针对缺氧亚群的靶向治疗,可以诱导胶质瘤血管正常化,提高抗肿瘤药物的递送效率,从而增强治疗效果。 该研究不仅加深了我们对胶质瘤免疫微环境的认识,也为未来开发针对肿瘤相关巨噬细胞的免疫治疗策略和抗肿瘤血管生成策略提供了新思路和可能性。
最新7分非肿瘤纯生信,极简易复现!
单基因生信分析:从入门到进阶的五大思路 嘿,大家好!今天咱们来聊聊生物信息学的那些事儿,特别是单基因生信分析。 首先,单基因生信分析到底是啥?简单来说,就是从生物信息学的角度,深入探讨某个目标基因在大样本中的表达情况和功能。这不仅能让你的研究更贴近临床实际,还能让你的文章内容更丰富,质量更高。是不是很心动?那就赶紧往下看吧! 常规思路:铜死亡单基因分析 这个方法最简单也最实用。你只需要找到相关的基因数据,然后进行一些基本的统计分析,比如表达量的变化、与临床指标的相关性等等。虽然简单,但往往能发现一些意想不到的结果。 干湿结合思路:铁死亡+非肿瘤疾病单基因分析+简单实验 这个方法稍微复杂一点,但也不难。你可以先做一些基础的生物信息学分析,比如铁死亡相关的基因表达变化,然后再结合一些非肿瘤疾病的数据进行综合分析。最后,还可以做一些简单的实验来验证你的发现。这样不仅能增加研究的深度,还能让你的发现更有说服力。 干湿结合思路:单基因泛癌分析+简单实验 这个方法和上一个类似,但更侧重于肿瘤相关的研究。你可以先进行一些单基因的泛癌分析,看看这个基因在多种肿瘤中的表达情况,然后再结合一些简单的实验来揭示肿瘤的机制。这种方法特别适合那些对肿瘤研究感兴趣的小伙伴们。 生信联合分析思路:基因家族+单基因分析 这个方法就更高级了。你可以先进行一些基因家族的分析,看看这个基因家族在整体上的表达情况,然后再结合单基因的分析来探索基因之间的相互作用。这种方法不仅能让你更全面地了解某个基因家族,还能发现一些新的研究方向。 生信联合分析思路:免疫相关单gene分析+单细胞数据分析 这个方法特别适合那些对免疫学感兴趣的小伙伴们。你可以先进行一些免疫相关的单基因分析,看看这个基因在免疫系统中的表达情况,然后再结合单细胞数据分析来揭示免疫细胞的奥秘。这种方法不仅能让你更深入地了解免疫系统,还能为免疫相关疾病的研究提供新的思路。 单基因生信分析的优势 应用广泛:不管你是研究什么疾病、什么目的,单基因生信分析都能帮你找到切入点。 基础入门:分析思路相对基础,非常适合初学者入门。 灵活多变:既可以单独成文,也可以结合实验形成大课题,随你怎么玩! 成本低收益高:它是增加数据量的利器,用最小的成本获得最大的收益。 总结 总之,单基因生信分析是一个非常强大且灵活的研究方法。无论你是初学者还是有一定经验的研究者,这项技术都能为你带来丰富的数据和新的发现。赶紧试试吧!က
᥌椺信分析新手攻略! 你是否对医学人生信分析感到迷茫?别担心,这里有一份入门攻略帮助你快速上手! 1️⃣ 确定研究领域 𑊩斥 ,要明确你的研究领域是肿瘤还是非肿瘤疾病。这样你才能知道该去哪里查找相关的数据。例如,TCGA数据库主要包含常见癌种数据,而GEO数据库则涵盖肿瘤及非肿瘤疾病。 2️⃣ 明确科研目标 𝠧科研目标是什么?是发表1分以上的期刊,还是3分以上的高分期刊?不同的目标需要不同的生信分析深度和思路。 3️⃣ 构建分析框架 在开始分析之前,你需要对生信分析有一个大致的框架理解。通过阅读前人文献,深入理解数据分析的设计思路和逻辑呈现,这样你在分析过程中就能更加得心应手。 4️⃣ 提升统计分析能力 具备统计分析能力对于生信分析至关重要。你需要能够敏锐地洞察每个分析结果,正确解读并捕捉细微的变化,以便进行深层次剖析。 5️⃣ 借助专业指导 颀능悦你想快速掌握生信分析并发表高分SCI论文,不妨寻求专业老师的指导。他们可以根据你的需求定制化教学,帮助你更加透彻地理解生信分析。 现在就踏上你的生信分析之旅吧!借助这份攻略,相信你一定能够取得优异的成果!
中山大学分享生信分析代码,免费获取! 中山大学终于整理出了进行生信分析所需的绘图代码,并免费分享给大家! 代码清单: WGCNA筛选表型相关基因.zip GEO多疾病差异分析.zip GEO数据库PCA散点图.zip ROC诊断曲线.zip GEO与TCGA共同差异基因.zip 多GEO数据库合并分析.zip GEO数据库处理分析.zip 预后模型多指标ROC.zip 独立预后分析.zip oncoPredict包基因表达与药物敏感性.zip 基因与药敏相关性.zip PFS.zip 多因素Cox模型.zip lasso回归模型.zip 线性回归以及非线性回归.zip 实验5空间分析.zip TCGA clinical.zip ComBat不同数据.zip ComBat.zip wilcox差异分析.zip 模型循环.zip 构建lasso回归预后模型.zip 临床相关性筛选.zip 共表达分析.zip 临床相关性分析.zip 多GEO数据去批次.zip 三种方法提取TCGA临床数据.zip WGCNA筛选hub基因.zip 预后相关基因筛选.zip 机器学习XGBoost.zip 机器学习GBM.zip 机器学习决策树.zip ROC分析.zip 机器学习模型ROC分析.zip 机器学习建模.zip 随机森林筛选基因.zip 生存分析.zip SVM筛选基因.zip 机器学习-asso筛选基因.zip 铜死亡相关基因筛选.zip 免疫治疗分析.zip 肿瘤突变负荷分析.zip 免疫浸润生存.zip 差异分析.zip 多组差异分析.zip 免疫检查点相关性.zip 三包差异交集.zip 免疫细胞相关性分析.zip DESeq差异分析.zip edgeR.zip 基因表达与免疫浸润关系.zip 免疫差异.zip 新TCGA.zip 肿瘤突变负荷分析2.zip 슥 疫浸润生存2.zip 찟슥𗮥析2.zip 슥䚧𗮥析2.zip 슥 疫检查点相关性2.zip 찟스𘉥 差异交集2.zip 슥 疫细胞相关性分析2.zip 슄ESeq差异分析2.zip 찟슥dgeR2.zip 슥 表达与免疫浸润关系2.zip 슥 疫差异2.zip 찟쀀
生信并不难,只需几步搞定! 你是否觉得生信分析高不可攀,需要深厚的编程和统计背景?其实不然!늊虽然掌握代码、复杂的R语言和大量的数学、统计知识无疑会让你在生信分析中如鱼得水,但对于临床医生或医学生来说,这几乎是不可能的。幸运的是,计算机专家们已经为我们提供了许多便捷的工具。 今天,我们就来探索如何使用在线工具——GEO2R,轻松绘制差异基因表达火山图,并理解其背后的科学意义。 首先,让我们了解一下GEO数据库。GEO全称为Gene Expression Omnibus,是一个存储大量肿瘤和非肿瘤数据的公共数据库。通过PubMed,我们可以轻松检索到GEO数据集。 以「lung cancer」为例,进入PubMed后,选择GEO DataSets进行检索。点击打开数据集后,你会看到关于该数据集的简要介绍,包括作者使用的芯片类型、病人数量以及分组信息等。 接下来,点击「Analyze with GEO2R」,根据作者定义的「Source name」,我们可以定义待分析的组别。通过勾选相应的组别,如图三所示,然后点击「Analyze」开始分析。 短暂的等待后,你会得到一张漂亮的差异基因表达火山图(如图四),可以直接保存图片,并下载数据。 这些漂亮的图是通过R语言进行可视化的,你可能都没注意到自己已经在使用R语言了! 生信分析并不难,只要你有信心和耐心,加上合适的工具,你也能轻松上手。快来试试吧!
生信R语言代码大全,助力SCI发表! 在进行生物信息学分析时,缺少关键的R语言代码真让人头疼 。为了帮助大家在撰写SCI论文时更加顺利,我特意整理了一些实用的R语言代码希望能帮到你们,避开那些不必要的弯路!拿走不用客气~ WGCNA筛选表型相关基因 GEO多疾病差异分析 GEO数据库PCA散点图 ROC诊断曲线 GEO与TCGA共同差异基因 多GEO数据库合并分析 GEO数据库处理分析 预后模型多指标ROC 独立预后分析 oncoPredict包基因表达与药物敏感性 基因与药敏相关性 PFS 多因素Cox模型 lasso回归模型 线性回归以及非线性回归 实验5空间分析 TCGA clinical ComBat不同数据 ComBat wilcox差异分析 模型循环 构建lasso回归预后模型 临床相关性筛选 共表达分析 临床相关性分析 多GEO数据去批次 三种方法提取TCGA临床数据 WGCNA筛选hub基因 预后相关基因筛选 机器学习XGBoost 机器学习GBM 机器学习决策树 ROC分析 机器学习模型ROC分析 机器学习建模 随机森林筛选基因 生存分析 SVM筛选基因 机器学习-asso筛选基因 铜死亡相关基因筛选 免疫治疗分析 肿瘤突变负荷分析 免疫浸润生存 差异分析 多组差异分析 免疫检查点相关性 三包差异交集 免疫细胞相关性分析 DESeq差异分析 edgeR 基因表达与免疫浸润关系 免疫差异 新TCGA
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