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内容来源:安定传媒所属栏目:热点更新日期:2024-11-27

晶胞论文

【「北大深圳研究生院陈语谦提出用于晶体结构弛豫不确定性量化的深度生成模型」】 北京大学深圳研究生院研究员、科学智能中心主任陈语谦与新加坡国立大学合作,在Nature Communications发表了题为“Scalable crystal structure relaxation using an iteration-free deep generative model with uncertainty quantification”的研究论文。该论文提出了一种单步晶体结构优化方法,避免了在使用第一性原理计算进行晶体结构优化时的迭代过程,为大规模晶体结构优化和高通量计算提供了高效的解决方案。北大深圳研究生院陈语谦提出用于晶体结构弛豫...

新加坡读博第82天:学习与生活全记录 今天是我来新加坡读博士的第82天,学习进度如下: 𐟌… 起床:8:30 𐟓š 上午:复习固体物理(晶体结构) 𐟕› 下午:12:00开始上课3小时,阅读了一篇论文 𐟍𝯸 午饭:15:30 𐟒䠥ˆ休:1小时 𐟌† 晚上:18:00开始上课3.5小时,观看了一节半导体物理网课,背诵了一篇新概念英语3的文章,与男朋友视频通话1小时 𐟌™ 睡觉:00:30 最近由于天气和气候的原因,我的右脚膝盖和左手臂关节开始疼痛。同学建议可能是湿气重导致的。来新加坡后,我尽量找些除了学习之外的事情做,让自己忙碌起来。之前爱上了听书,听完了《中国通史》和《穷爸爸富爸爸》。最近追剧《田耕纪》,每天晚上更新2集,既不沉迷,又觉得挺好。 虽然最近一直下雨,但应该是入秋了,脸霜用完了,皮肤变得很干,甚至有点起皮。还是要鼓励自己多运动,跑步是个不错的选择,既能运动又能静心思考问题。加油!

多伦多大学工程新生必知8门课攻略 多伦多大学工程学院的Core 8课程在大一上学期共有12门课,分为上下两个学期。上学期需要完成6门课,这6门课的难度和内容如下: APS 100:这是一门入门课程,分数不计入GPA,只有通过和不通过之分。 APS 111:工程论文课,分数由40%的个人作业和60%的小组作业组成。运气好的话,遇到好的组员可以轻松拿高分,否则难度较大。 APS 110:材料基础课,主要讲解晶体结构和应力应变曲线等基础知识,难度较低。 MAT 186:微积分课,如果高中学过AP calculus,这门课会比较容易,基本上是高中知识的延续。 MAT 188:线性代数课,需要较强的空间想象力,难度适中。 CIV 100:机械学,是上学期最难的一门课,平均分也是最低的,需要努力学习。 转专业的要求是平均分达到80分以上,这意味着至少需要一门课高于80分,其他课的分数也需要有一定的容错率。因为除非学习能力很强,否则很难将所有课的分数都保持在80分以上。例如,APS 111和CIV 100的分数大部分人都在73左右,所以需要注意。不过,也不用太担心,因为要求虽然是平均分80分,但并不意味着需要将5门课都同时修完。如果需要,可以drop 1-2门课,但这需要与导师沟通。 以上是大一上学期的课程简述,如果需要更多帮助,可以联系在读研究生,他们可以提供一些辅导服务,包括MAT 186、MAT 188、CIV 100和APS 110等课程。

【“超级海绵”家族“新成员”获证实】北京化工大学教授冯越课题组与加州大学旧金山分校教授Joseph Bondy-Denomy课题组合作,证实了目前已知的仅有的三种海绵蛋白——Acb2、Tad1、Tad2均为具有多个结合位点隔离信号分子的“超级海绵”,这一发现暗示具有多个信号分子结合位点的反防御蛋白可能广泛存在,从而建立了噬菌体反防御“海绵蛋白”研究的新范式。10月30日,相关研究成果在线发表于《自然》。论文传送门☞网页链接 在微生物的世界里,细菌和噬菌体之间的斗争犹如一场没有硝烟的“军备竞赛”。细菌“道高一尺”,建立了多种抗噬菌体防御系统来抵御噬菌体入侵。而面对细菌的防御手段,噬菌体“魔高一丈”,编码众多反防御蛋白,从不同阶段去干扰细菌的防御系统,以此来保障自己能够成功侵染细菌。 近年来,冯越课题组陆续阐明了噬菌体多种反防御蛋白以及可同时抑制CRISPR-Cas系统和CBASS系统的Acb2蛋白的抑制机制。中外课题组合作报道了Acb2这一反防御蛋白,通过两种不同的结合口袋吸附所有目前已知的CBASS以及III型CRISPR-Cas系统的信号分子,因此称其为“超级海绵”。 为了揭示噬菌体抗Thoeris系统蛋白Tad蛋白结合信号分子的机制,冯越组解析了Tad蛋白与多种环状寡核苷酸的复合物晶体结构。他们发现Tad1蛋白以六聚体形式存在,而不是之前报道的二聚体,Tad1像一个拥有两个“隔离舱”的“分子飞船”,能形成两个独立口袋隔离两个CTN,同时Tad1还使用与gcADPR分子相同的结合口袋隔离CDN。而Tad2则是一个四聚体,可同时与两个CDN和两个gcADPR分子结合。 更有意思的是,他们发现Tad2的一个homolog(HgmTad2)对cGG的结合亲和力高达24pM,是目前已报道的亲和力最强的cGG结合蛋白,也远高于目前报道的海绵蛋白对信号分子的亲和力。在细菌中,cGG是最广泛的CDN,它像一个“关键枢纽”参与调节细菌生长和行为包括运动、毒力、生物膜形成和细胞周期进程等多个方面。 课题组证实了,Tad1和Tad2蛋白与Acb2均为具有两种不同的结合口袋的“超级海绵”,从而将目前发现的仅有的三个噬菌体海绵蛋白均统一为多结合口袋的“超级海绵”。(来源:中国科学报 温才妃)

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