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【人工智能助力RNA病毒研究】 10月9日,中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》杂志发表论文,报告了全球范围的180个超群、16万余种的RNA病毒发现,大幅扩展全球RNA病毒的多样性。该研究将人工智能技术应用于病毒鉴定,探索了病毒学研究的新路径。 传统的病毒发现方法高度依赖既有知识,面对RNA病毒这种高度分化、种类繁多且容易变异的病毒识别效率低。在该研究中,研究团队开发了一种人工智能算法,其能对病毒和非病毒基因组序列深度学习,并自主判断病毒序列。利用这套算法,研究团队在来自全球生物环境样本的10487份RNA测序数据中发现了超过51万条病毒基因组,代表超过16万个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。“人工智能的算法模型能够挖掘出我们之前忽略或根本不知道的病毒,这在疾病防控和新病原的快速识别中尤为重要。特别是在疫情暴发时,人工智能的速度和精度可以帮助科学家更快地锁定潜在病原体。”施莽说。 来源:光明日报 #辽宁好网民守法好公民##有一种美好叫辽宁##振兴新突破辽宁杠杠滴#
【「我国科学家利用AI发现超16万种RNA病毒」】「AI一举发现了超16万种新病毒」10月9日,国际学术期刊《细胞》发表中山大学与阿里云合作的科研成果,研究团队利用云计算与人工智能(AI)技术发现了180个超群、16万余种全新RNA病毒,是已知病毒种类的近30倍。 团队对来自全球生物环境样本的10487份数据进行病毒挖掘,发现了513134条病毒基因组,代表161979个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。使RNA病毒超群数量扩容约9倍,病毒种类增加约30倍,其中23个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。 论文还揭示多个病毒学领域新发现:发现迄今为止最长的RNA病毒基因组,长度达到47250个核苷酸;识别出超出以往认知的基因组结构,展示了RNA病毒基因组进化的灵活性;此外,在高温的深海热泉等极端环境中,RNA病毒依旧存在多样性。智慧生活报的微博视频
中国科学家发现一种新病毒 现在中国科学家在顶刊上发表的重磅研究越来越多了。9月27日,新英格兰医学周刊发表了题为《一种和人类发热疾病相关的新型正内罗病毒》的论文,作者主要来自北京微生物与流行病学研究所的病原体与生物安全国家重点实验室,另一家著名医学期刊JAMA对这个研究作了介绍: 在过去十年中,世界各地发现了多种新的蜱传播病毒。最新的发现是一种被称为“湿地病毒”(WELV)的正内罗病毒。 2019年,研究人员在中国东北一位因发烧和多器官衰竭住院的患者中首次发现了该病毒。 研究人员检测了680名被蜱叮咬后发烧的患者,其中20人呈湿地病毒阳性。他们的症状包括发烧、恶心、呕吐等非特异性症状,个别患者出现了昏迷等神经症状。 科学家做了进一步研究,发现被注射这种湿地病毒(WELV)的老鼠表现出脑部病理变化,这就进一步说明了这种病毒对大脑可能致病。 另外,研究人员在这个地区的14,500只蜱虫中检测出约2%的蜱虫携带WELV,确定了血蜱(Haemaphysalis concinna)可能是传播媒介。湿地病毒还在老鼠、羊、猪和马等动物中被发现。 研究人员指出,WELV存在于多种动物中,可能导致了蜱虫之间的传播增加,从而传染给人类。 研究人员建议:加强对正内罗病毒的监测可能有助于更好地了解其对人类健康的影响。 (原文见链接) 「健闻登顶计划」「我的防护手册」
今天看到的一条新闻,阿里太争气了,两个第一让外媒也是无话可说! 刚刚在手机上看到这样一条新闻,国际顶级学术期刊《Cell》发表了中山大学和阿里云合作的研究成果,研究团队利用云计算能力和AI技术发现了16万多种全新RNA病毒。 这个消息太让人提气了,为什么这么说呢?因为它做到了两个第一! 第一次,发现16万多种RNA病毒。可能很多人不知道,以前人类已知的病毒种类仅仅只有5000多种,而这次,阿里云通过AI技术,直接发现了16万多种,也就是说,将人类对于病毒种类的认识直接扩展了30倍,这无疑是阿里云在基础科学领域又迈出的重要一步。 如此一来,既可以加快我们对病毒研究的进程,同时也为以后的病毒学研究打了个样。某种程度上说,阿里云的举动,是对于科技进步的一个巨大的推动。将过去很多病毒领域的的“未知”变成了“已知”,可以避免很多疾病的出现。 第一次,基于生命科学领域在CNS顶级期刊发表论文。随着阿里云的研究成果登上《Cell》期刊,也就意味着,阿里成了国内首个基于生命科学,在CNS这样的国际顶级期刊发表论文的科技公司。 这既是一个新的突破,也是中国科技企业向外展露技术实力的一次最好证明。 过去,西方很多国家总是看不起我们,看不起中国的技术,但是如今中国的科技企业能够登上国际顶级期刊,这就足以说明,我们的实力并不比他们差,中国企业的技术实力也是世界领先的,对于这一点,外媒怕是也无话可说了!
[鲜花]10 月 9 日,中山大学医学院施莽教授团队与阿里云李兆融团队在《细胞》(Cell)杂志上发表论文,报告了 180 个超群、超过 16 万种全球 RNA 病毒的发现,这是迄今为止规模最大的 RNA 病毒研究,大幅扩展了全球 RNA 病毒的多样性,该研究将人工智能技术应用于病毒鉴定,发现了传统方法未能发现的病毒“暗物质”,探索了病毒学研究的新路径。 [太阳]据介绍,传统的病毒发现方法包括病毒分离和生命组学的生物信息学分析,高度依赖既有知识,面对 RNA 病毒这种高度分化、种类繁多且容易变异的病毒识别效率低。该研究团队开发的 LucaProt 人工智能算法能够对病毒和非病毒基因组序列深度学习,并在数据集中自主判断病毒序列。 [超人爸爸]LucaProt 是一种能够深度学习的 Transformer 模型,在大量学习病毒和非病毒基因组序列后,可以自主形成一套关于病毒的判断标准,从而在大量的 RNA 测序数据集中挖掘出病毒序列。在测试中,LucaProt 表现出极高的准确性和特异性,假阳性率为 0.014%,假阴性率为 1.72%。在与其他病毒挖掘工具的对比中,它也在处理较长序列的方面展现出优势。 [看涨]利用 LucaProt,研究团队对来自全球生物环境样本的 10,487 份 RNA 测序数据进行病毒挖掘,发现了超过 51 万条病毒基因组,代表超过 16 万个潜在病毒种及 180 个 RNA 病毒超群(相当于门或纲的分类级别),使 RNA 病毒超群数量扩容约 9 倍。其中 23 个超群无法通过序列同源方法识别,被称为病毒圈的“暗物质”。 [话筒]在这项研究中,团队报告了迄今最长的 RNA 病毒基因组,长度达到 47,250 个核苷酸;发现了超出以往认知的基因组结构,展现出 RNA 病毒基因组进化的灵活性;识别到多种病毒功能蛋白,特别是与细菌相关的功能蛋白,进一步表明还有更多类型的 RNA 噬菌体亟待探索。研究指出,新发现的病毒分布在地球的各类生态环境中。总体上,落叶层、湿地、淡水和废水环境的病毒多样性最高。然而,在南极底泥、深海热泉、活性污泥和盐碱滩等极端环境中,RNA 病毒的多样性和丰度并不低,甚至在深海热泉的高温环境中,仍有 RNA 病毒在活跃复制。 [照相机]LucaProt 虽然是一个专门为 RNA 病毒发现设计的模型,但它同时融合了对蛋白质序列和隐含结构信息识别的功能,也可用于蛋白质功能的鉴定。在论文中,研究团队开源了 LucaProt 模型,并通过在线网站分享给全球科学家。
这个,真牛逼了。。。你们看看牛逼在哪里?不用我讲了吧?【严欢团队】【石正丽,黄美玲,刘鹏,郭华】学者动态 | 严欢教授团队在《自然》上发表研... 学者动态 | 严欢教授团队在《自然》上发表研究论文 严欢团队从ACE2受体出发,以新冠病毒为研究模型,深入分析了影响受体功能性的关键因素,开发了一套适用于冠状病毒的人工受体模块化设计方案,并与David Veesler团队合作通过结构生物学手段进一步揭示了人工受体发挥功能的分子机制。利用人工受体技术,严欢团队为来自6个不同亚属的12种冠状病毒设计了具有功能性的CVR。通过与石正丽团队合作,CVR感染模型成功实现了HKU5等冠状病毒的分离培养。通过为一些受体未明且缺乏感染模型的病毒设计人工受体,有望突破病毒学研究瓶颈,促进相关病毒感染致病机制的基础研究以及疫苗与抗病毒药物的开发。 严欢团队另辟蹊径地提出了“设计人工病毒受体”的新设想,采取类似于“乐高积木”的模块化设计思路,将完整的受体分解为“病毒结合域(VBD)”与“人工受体框架(ARS)”两部分分别进行设计与优化,最终通过分子嫁接获得定制化病毒受体(Customized coronavirusreceptors,CVR)。 武汉大学人事部 2024年10月31日 16:16 湖北 1人听过 以下文章来源于武汉大学 ,作者追求卓越的 10月30日,武汉大学生命科学学院、病毒学国家重点实验室、泰康生命医学中心严欢团队,广州实验室、中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队以及华盛顿大学David Veesler团队合作在国际顶级期刊Nature 在线发表了题为“Design of customized coronavirus receptors”的研究论文。严欢团队首次提出“定制化病毒受体(CVR)”的概念,旨在不依赖天然受体的条件下构建易感细胞模型。严欢、石正丽和David Veesler为论文的共同通讯作者;武汉大学生命科学学院博士生刘鹏、硕士生黄美玲,中国科学院武汉病毒所博士后郭华,华盛顿大学Matthew McCallum为论文的共同第一作者。 受体识别是病毒感染与传播过程中的关键事件。细胞上的受体分子既是理解病毒入侵机制的核心线索,也是构建感染模型、推动机制研究和药物研发的基础。然而,天然受体鉴定工作存在较高的不确定性与滞后性,有些重要病毒的受体鉴定几十年未有突破,严重阻碍了相关病毒学研究的深入推进。 面对这一挑战,严欢团队另辟蹊径地提出了“设计人工病毒受体”的新设想,采取类似于“乐高积木”的模块化设计思路,将完整的受体分解为“病毒结合域(VBD)”与“人工受体框架(ARS)”两部分分别进行设计与优化,最终通过分子嫁接获得定制化病毒受体(Customized coronavirusreceptors,CVR)。 图片 人工病毒受体的设计思路 严欢团队从ACE2受体出发,以新冠病毒为研究模型,深入分析了影响受体功能性的关键因素,开发了一套适用于冠状病毒的人工受体模块化设计方案,并与David Veesler团队合作通过结构生物学手段进一步揭示了人工受体发挥功能的分子机制。利用人工受体技术,严欢团队为来自6个不同亚属的12种冠状病毒设计了具有功能性的CVR。通过与石正丽团队合作,CVR感染模型成功实现了HKU5等冠状病毒的分离培养。通过为一些受体未明且缺乏感染模型的病毒设计人工受体,有望突破病毒学研究瓶颈,促进相关病毒感染致病机制的基础研究以及疫苗与抗病毒药物的开发。 图片 人工病毒受体的科学与应用价值 据悉,该论文是严欢团队继2022年12月Nature发文后的第二项重大研究成果。该研究得到了武汉大学泰康生命医学中心、国家自然科学基金、国家重点研发计划等项目的资助。 论文链接: 网页链接 图片 来源:武汉大学新闻网 编辑:鲁思佳 邓白露 审核:李洁珩 审核发布:付磊 图片 阅读 393
新冠这个事情美国医药“复合体”真的是跳进黄河都洗不清。合成新冠病毒发表了论文的,科研主导人参与军方项目也是有公开记录的。还有那个被套话的黑人也说新冠就是医药公司散播。我都不知道美国人怎么没在这个事情上爆发。#动态连更挑战#
「阿里云成果登顶刊Cell」 刚刚,阿里云官宣和中山大学合作的科研成果登上国际顶刊《Cell》。 简单来说,研究团队利用云计算与AI技术发现了—— 180个超群、16万余种全新RNA病毒,这是已知病毒种类的近30倍,大幅提升了业界对RNA病毒多样性和病毒演化历史的认知。 展开讲,新研究瞄准的痛点是:新病毒发现的效率较低。 传统RNA病毒鉴定方法高度依赖于序列同源性比对,即通过比较未知病毒与已知病毒的序列相似性来进行识别。 然而,RNA病毒种类繁多且高度分化,传统方法难以捕捉缺乏同源性或同源性极低的“暗物质病毒”。 而AI与病毒学研究的结合正在突破这一难题。 相关论文提出了全新的深度学习模型"LucaProt"—— 它基于Transformer框架与大模型表征技术,结合蛋白质序列和内在结构性特征,在独立的测试数据集上表现优异,具有极高的准确性(假阳性率仅为0.014%)和特异性(假阴性率为1.72%)。 从结果看,通过对来自全球生物环境样本的10,487份数据进行病毒挖掘,发现了513,134条病毒基因组,代表161,979个潜在病毒种及180个RNA病毒超群。 此外,论文还揭示了多个病毒学领域新发现: 1、发现迄今为止最长的RNA病毒基因组,长度达到47,250个核苷酸; 2、识别出超出以往认知的基因组结构,展示了RNA病毒基因组进化的灵活性; 3、在高温的深海热泉等极端环境中,RNA病毒依旧存在多样性。 论文地址:网页链接
《詹纳传》:疫苗之父的传奇人生 如果有人问你,哪种传染病病毒是人类历史上第一个被消灭的,很多人可能会想到天花。但你知道吗?这一切都要归功于一位英国的外科医生——爱德华ⷨ鹧他的发现不仅拯救了无数人的生命,还让人类与天花病毒彻底划清了界限。 这本书的前半部分详细讲述了詹纳的一生。从他的出生、求学,到成为一名医生,再到最终发现牛痘疫苗并推广它的过程。你还能看到他当时写的三篇论文的中文版,这些论文详细记录了他的实验过程和发现。 詹纳不仅是一位医生,还是一位博物学家。他和他的导师亨利一起研究杜鹃的巢寄生、动物冬眠、鸟类迁徙以及血清对植物的影响。这些研究都表明,科学是相通的。詹纳拥有出色的观察、推理和解决问题的能力,正是这些能力让他最终发现了疫苗。 在詹纳发现疫苗之前,人们防御天花的方法是人痘接种。这种方法虽然有一定的效果,但使用的是活性的天花病毒,因此有一定的致死率。虽然经过长时间的研究,这种方法的致死率已经控制得比较低,但整体风险还是不如疫苗低。而詹纳发现的牛痘病毒可以让人对天花产生免疫,且对人无害,因此接种牛痘病毒来预防天花的风险性大大降低。 然而,在推广疫苗的过程中,詹纳遇到了许多阻力。比如如何保证牛痘苗的正确性和可用性,以及接种感染等问题。面对这些突发事件,詹纳展现出了惊人的细节分析能力和推理能力。他通过观察现象、分析原因,并展开实验来证实自己的想法。这个过程也充分体现了科学思维的过程。最终,詹纳一步步解决了这些问题,并将疫苗从英国推广到全球。 作为一名高中生物老师,我觉得这本书非常适合作为学生的课外读物。书中不仅详细讲解了疫苗的原理,还记录了詹纳做实验的过程和总结,这有助于培养学生的科学思维能力。非常推荐给高中生阅读!
我国最新发现!实验中99%有效抑制艾滋病病毒! 长期以来 抗逆转录病毒疗法(ART) 在抑制人体免疫缺陷病毒(HIV) 复制方面效果显著 延长了艾滋病患者的寿命 但该疗法同时也带来严重的副作用 并导致大量耐药病例的出现 图片 9月24日,记者从南京大学了解到,该校科研团队从羊驼体内分离出一种抗体,它能够与艾滋病病毒受体结合。实验中,该抗体抑制艾滋病病毒的有效率超过99%,体现出良好的广谱性和抗病毒活性。相关成果近期发表在国际学术期刊《自然ⷩ讯》上,有望为新药研发提供思路。 据论文共同通讯作者、南京大学医学院教授吴稚伟介绍,临床上主要采用抗逆转录病毒疗法抑制艾滋病病毒复制,效果显著,能够有效延长患者寿命,但也会导致病毒产生严重的耐药性,因此急需研究新疗法。目前,艾滋病新药研发的思路主要从病毒进入宿主细胞的过程入手,在这一过程中,一个名为CD4的受体就像“门把手”,病毒利用它才能打开细胞的“大门” “我们从羊驼体内分离出上千个CD4的纳米抗体,其中Nb457这种抗体展现出抑制艾滋病病毒的潜力。”吴稚伟告诉记者,团队构建了一系列假病毒,以模拟全世界有代表性的117种艾滋病病毒株。在将Nb457抗体与假病毒相互作用后发现,该抗体有效抑制了其中116种病毒株的感染,显示出良好的广谱性和抗病毒活性. 图片 论文另一位共同通讯作者、南京大学医学院研究员吴喜林介绍,在真病毒测试中,由Nb457工程化改造而来的三聚体纳米抗体,对艾滋病病毒实现了强效抑制。在后期小鼠实验中,为感染艾滋病病毒的小鼠注射三聚体纳米抗体后,研究人员在小鼠体内几乎检测不到病毒,也没有发现耐药突变现象。 吴稚伟表示,艾滋病病毒变异速度快,容易产生耐药性,导致药效下降。此次发现的新抗体并不针对病毒本身,而是CD4这个“门把手”,因此不易导致病毒产生耐药性,对艾滋病新药研发和临床治疗具有重要启发意义。
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