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琼脂糖凝胶电泳实验全攻略 젥ꌧ𛋊琼脂糖凝胶电泳是一种用于检测DNA含量、分子量和分离不同大小DNA片段的技术。实验中,琼脂糖作为支持介质,利用电泳原理,通过电场作用使带电粒子(如DNA分子)在凝胶中移动,从而实现分离。 ꠥꌦꤊ凝固琼脂糖:将琼脂糖完全凝固后,小心取出梳子,将凝胶置于电泳槽中。 加入电泳缓冲液:向电泳槽中加入电泳缓冲液,液面需高于胶面2~5mm,以确保凝胶两端的电压与外加电压相等。 准备样品:在DNA样品中加入含有蔗糖或甘油及指示剂的上样缓冲液,以防止样品在电泳槽中上飘并指示电泳位置。 加样:用移液枪将DNA样品加入样品孔中,每孔加样量一般在10~20微升。加样时不必每个样品换枪头,可在阳极槽中反复吸打电泳缓冲液以冲洗枪头。 电泳:以加样孔侧为负极,接通电泳槽与电泳仪的电源,电泳时以低温为好,电压5~15v/cm。 观察结果:在蓝光灯下观察并记录实验结果。 미 实验现象 电泳时,正负极均有气泡产生,负极产生的气泡明显多于正极。盖子上有一层水雾。在蓝光灯下未观察到本组的DNA样本向前泳动的条带。 分析讨论 气泡产生原因:水是弱电解质,在直流电作用下,放出氢气与氧气,氢离子与氢氧根离子不断减少,使水不断减少。负极产生的气泡多于正极的原因是:电泳过程中,两分子水分解在正极产生一分子氧气,在负极产生两分子氢气,所以负极产生气体的量是正极的两倍。 DNA显带未观察到的原因: 未提取到DNA:在全血基因组DNA的提取实验中,加入SDS溶液后未观察到明显的沉淀,导致后续用100微升TE缓冲液溶解DNA时只能盲目反复冲洗试管壁,可能未能提取到有效的DNA片段。 DNA浓度较低:当DNA量低于电泳可以检测的下限时,将无法在琼脂糖凝胶上显现条带,因为低浓度DNA对应的DNA分子数量太少,进入凝胶后分布稀疏,无法形成可见的条带结构。 DNA分子破碎:提取或处理过程中操作不当,可能产生机械力使基因组DNA断裂,产生很短的DNA片段,无法进入凝胶。 取样量不足:少量DNA难以显现明显条带。 存在干扰物质:蛋白质、脂质残留可能与DNA混合,影响迁移速率。提取的DNA样品中可能存在部分蛋白质残留,高浓度的白蛋白残留会导致电泳无DNA显带的产生。 参考文献 Smith A, Brown B, Green C. Investigation of non-visible DNA bands in agarose gel electrophoresis caused by low DNA concentration. Journal of Biochemistry, 2020, 167(2):35-39. Wang W, Li K, Zhang Z. The influence of fragmented DNA on the result of agarose gel electrophoresis. Sci Rep, 2021, 11:5623. Li X, Chen Y, Guo J. Protein contamination interfering with DNA band presentation in agarose gel electrophoresis. Electrophoresis, 2019, 40:429-433.
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